‏تشبه الطحالب الخضراء - المزرقة البكتيريا لحد كبير في بساطة خليتها من جهة ، وفي تركيب جدارها الخلوي غير الطبيعي من جهة ثانية ، لذا لا غرابة أن نجد بعض علماء البيولوجيا يقترح تصنيفها كنوع آخر من البكتيريا الذاتية التغذية .

كما تشبه (الطحالب الخضراء - المزرقة ) النباتات والطحالب من حيث أن خلاياها تحتوي على مادة الكلورفيل التي تمتص أشعة الشمس مع الماء لتكوين مركبات السكر - المصدر الأساسي للطاقة .

‏تعيش الطحالب الخضراء - المزرقة في الماء العذب غالباً ، وتوجد إما كخلايا مفردة أو متجمعة أو سلسلة من الخلايا .

ولهذه الكائنات الحية أهمية اقتصادية ، إذ إن الأبحاث العلمية تشير إلى أن لها القدرة على تثبيت نيتروجين الهواء في التربة مما يزيد خصوبة الأرض وبالتالي الانتاج الزراعي وهي بذلك تشبه بكتيريا التأزت .